一般情况下，按照富硒农产品中硒的来源区分，富硒农业可分为天然富硒农业与外源富硒农业两种；如果按照富硒农业所属的农业产业类型区分，富硒农业可分为富硒种植业、富硒养殖业和富硒加工业这三种类型。

        硒资源是富硒农业发展的核心因素。富硒农业的发展对硒元素具有极强的依赖性，不论是在国外还是在国内，富硒农业均是先在土壤富硒区发展，其次才慢慢延伸到缺硒地区。我国虽然大部分地区缺硒，但也存在部分硒含量很高的地区，有效开发高硒地区的硒资源应用到全国范围，以平衡我国部分富硒区居民硒摄入过量、而缺硒区居民硒摄入不足的问题至关重要。

       富硒农业的发展对生物技术具有较强的依赖性。富硒农业其实就是将环境中的硒通知一定的生物转化作用转化为对人体有益的有机硒形态。在富硒区与缺硒区对富硒技术时要求存在着一定的差异。富硒区主要是控制富硒农产品硒含量的稳定及重金属含量；缺硒区也需要控制农产品中硒含量的稳定性，但更重要的是硒营养强化剂的开发，包括植物所需的富硒肥及动物所需的富硒饲料。不同形态的硒对作物或动物的效果不同，每一种作物或动物对硒的吸收及转化效率都存在着较大差异，因此在一种硒营养强化剂投入市场之前，需要进行大量的科学试验。

       富硒农业属于功能农业，与人体健康息息相关。随着我国部分慢性病的发病率逐渐增加以及我国呈现人口老龄化趋势，人们不再只满足于基本的温饱问题，越来越开始关注健康营养功能农产品的开发。

        随着富硒农产品总量增加、品种丰富和消费升级的变化，富硒粮食、富硒蔬菜、富硒水果及富硒畜禽产品等逐渐向加工方向发展。富硒农产品加工具有较高的技术要求，主要包括富硒作物及功物原料标准控制、加工处理技术、加剂和助剂、储藏及终端产品质量控制等。